Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PAX8Q06710 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PAX8Q06710 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms