Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAD51Q06609 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms