Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CALD1Q05682 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CALD1Q05682 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms