Protein–RNA interactions for Protein: Q04217

ECM16, Probable ATP-dependent RNA helicase DHR1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ECM16Q04217 ORM2YLR350W 651 nt5.41□□□□□ -1.54
ECM16Q04217 ATG8YBL078C 354 nt5.41□□□□□ -1.54
ECM16Q04217 RAD17YOR368W 1206 nt5.41□□□□□ -1.54
ECM16Q04217 ARX1YDR101C 1782 nt5.41□□□□□ -1.54
ECM16Q04217 TIF4632YGL049C 2745 nt5.41□□□□□ -1.54
ECM16Q04217 PAF1YBR279W 1338 nt5.41□□□□□ -1.54
ECM16Q04217 APC1YNL172W 5247 nt5.41□□□□□ -1.54
ECM16Q04217 IOC4YMR044W 1428 nt5.4□□□□□ -1.54
ECM16Q04217 SUR2YDR297W 1050 nt5.4□□□□□ -1.54
ECM16Q04217 MCM21YDR318W 1107 nt5.4□□□□□ -1.54
ECM16Q04217 RPB7YDR404C 516 nt5.4□□□□□ -1.54
ECM16Q04217 UPS2YLR168C 693 nt5.4□□□□□ -1.54
ECM16Q04217 NPL4YBR170C 1743 nt5.4□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 IMA3YIL172C 1770 nt5.39□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 IMA4YJL221C 1770 nt5.39□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 YEL074WYEL074W 339 nt5.39□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 LSO1YJR005C-A 282 nt5.39□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 NMA1YLR328W 1206 nt5.39□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 YMR114CYMR114C 1107 nt5.39□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 YIM2YMR151W 438 nt5.39□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 SPS19YNL202W 879 nt5.39□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 YNL234WYNL234W 1281 nt5.39□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 CIN5YOR028C 888 nt5.39□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 ORC6YHR118C 1308 nt5.39□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 TRM13YOL125W 1431 nt5.39□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 SWC3YAL011W 1878 nt5.39□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 ZPR1YGR211W 1461 nt5.39□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 MMT1YMR177W 1533 nt5.38□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 CYM1YDR430C 2970 nt5.38□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 BBC1YJL020C 3474 nt5.38□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 GAD1YMR250W 1758 nt5.38□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 snR78snR78 87 nt5.38□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 BUD30YDL151C 582 nt5.38□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 YGL101WYGL101W 648 nt5.38□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 VMA22YHR060W 546 nt5.38□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 RPP0YLR340W 939 nt5.38□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 PET20YPL159C 762 nt5.38□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 snR19snR19 568 nt5.38□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 ARC40YBR234C 1155 nt5.38□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 CUS1YMR240C 1311 nt5.38□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 PEP5YMR231W 3090 nt5.38□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 HRK1YOR267C 2280 nt5.37□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 PUF2YPR042C 3228 nt5.37□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 AVT1YJR001W 1809 nt5.37□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 PER1YCR044C 1074 nt5.37□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 YLF2YHL014C 1218 nt5.37□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 YNR061CYNR061C 660 nt5.37□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 NMD3YHR170W 1557 nt5.37□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 LPP1YDR503C 825 nt5.36□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 MRM2YGL136C 963 nt5.36□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 TVP38YKR088C 1014 nt5.36□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 URE2YNL229C 1065 nt5.36□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 POP3YNL282W 588 nt5.36□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 TDA6YPR157W 1404 nt5.36□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 NOP58YOR310C 1536 nt5.36□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 YPK3YBR028C 1578 nt5.36□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 PRP28YDR243C 1767 nt5.36□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 MNN4YKL201C 3537 nt5.35□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 VID22YLR373C 2706 nt5.35□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 MIH1YMR036C 1665 nt5.35□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 RKM3YBR030W 1659 nt5.35□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt5.35□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 SFH5YJL145W 885 nt5.35□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 JLP1YLL057C 1239 nt5.35□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 VPS71YML041C 843 nt5.35□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 CCS1YMR038C 750 nt5.35□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 PFK1YGR240C 2964 nt5.35□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 YDL124WYDL124W 939 nt5.34□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 YDR282CYDR282C 1245 nt5.34□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 YER145C-AYER145C-A 438 nt5.34□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 YGL199CYGL199C 471 nt5.34□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 UBI4YLL039C 1146 nt5.34□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 REX3YLR107W 1215 nt5.34□□□□□ -1.55
ECM16Q04217 PUT2YHR037W 1728 nt5.34□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 CTT1YGR088W 1689 nt5.34□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 HSP82YPL240C 2130 nt5.33□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 MET4YNL103W 2019 nt5.33□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 PUS9YDL036C 1389 nt5.33□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 KAP114YGL241W 3015 nt5.33□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 SAC1YKL212W 1872 nt5.33□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 NUP42YDR192C 1293 nt5.33□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 MRP13YGR084C 1020 nt5.33□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt5.33□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 YIL165CYIL165C 360 nt5.33□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 KTR2YKR061W 1278 nt5.33□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 FBP1YLR377C 1047 nt5.33□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 TIF5YPR041W 1218 nt5.33□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 THI7YLR237W 1797 nt5.33□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 GDE1YPL110C 3672 nt5.33□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 CDC48YDL126C 2508 nt5.33□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 IME4YGL192W 1803 nt5.32□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 PAH1YMR165C 2589 nt5.32□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 YHL049CYHL049C 816 nt5.32□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 ERD2YBL040C 660 nt5.32□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt5.32□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 GLN4YOR168W 2430 nt5.32□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 IMD2YHR216W 1572 nt5.31□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 YDR133CYDR133C 336 nt5.31□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 TAF10YDR167W 621 nt5.31□□□□□ -1.56
ECM16Q04217 YGL088WYGL088W 366 nt5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.8 ms