Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARID5AQ03989 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARID5AQ03989 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms