Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUCB1Q02818 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUCB1Q02818 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUCB1Q02818 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUCB1Q02818 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUCB1Q02818 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUCB1Q02818 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUCB1Q02818 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUCB1Q02818 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUCB1Q02818 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUCB1Q02818 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NUCB1Q02818 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NUCB1Q02818 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NUCB1Q02818 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
NUCB1Q02818 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NUCB1Q02818 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUCB1Q02818 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NUCB1Q02818 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUCB1Q02818 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUCB1Q02818 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NUCB1Q02818 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NUCB1Q02818 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NUCB1Q02818 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NUCB1Q02818 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUCB1Q02818 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NUCB1Q02818 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NUCB1Q02818 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUCB1Q02818 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUCB1Q02818 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUCB1Q02818 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NUCB1Q02818 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NUCB1Q02818 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUCB1Q02818 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NUCB1Q02818 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUCB1Q02818 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUCB1Q02818 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUCB1Q02818 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
NUCB1Q02818 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NUCB1Q02818 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NUCB1Q02818 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NUCB1Q02818 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms