Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SPTBN1Q01082 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SPTBN1Q01082 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms