Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MDM2Q00987 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MDM2Q00987 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MDM2Q00987 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms