Protein–RNA interactions for Protein: Q00362

CDC55, Protein phosphatase PP2A regulatory subunit B, yeastyeast

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CDC55Q00362 MDY2YOL111C 639 nt5.95□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 CUP9YPL177C 921 nt5.95□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 RPL7BYPL198W 735 nt5.95□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 SMF1YOL122C 1728 nt5.94□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 SNU23YDL098C 585 nt5.94□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 snR82snR82 268 nt5.94□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 YDR203WYDR203W 318 nt5.94□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 YAP6YDR259C 1152 nt5.94□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 SPT3YDR392W 1014 nt5.94□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt5.94□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 RPL27AYHR010W 411 nt5.94□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 SEN34YAR008W 828 nt5.94□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 UPS2YLR168C 693 nt5.94□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 YLR317WYLR317W 435 nt5.94□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 YMR099CYMR099C 894 nt5.94□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 SER1YOR184W 1188 nt5.94□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 OCT1YKL134C 2319 nt5.94□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 POL31YJR006W 1464 nt5.94□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 PUF3YLL013C 2640 nt5.94□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 SSK1YLR006C 2139 nt5.93□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 PAT1YCR077C 2391 nt5.93□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 ERG4YGL012W 1422 nt5.93□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 YCR108CYCR108C 192 nt5.93□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 PDE1YGL248W 1110 nt5.93□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 PRS1YKL181W 1284 nt5.93□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt5.93□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 SEC14YMR079W 915 nt5.93□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 PFA3YNL326C 1011 nt5.93□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt5.93□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 NOG2YNR053C 1461 nt5.93□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 MRC1YCL061C 3291 nt5.92□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 BET1YIL004C 429 nt5.92□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 TPK1YJL164C 1194 nt5.92□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 SWD2YKL018W 990 nt5.92□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 SEC13YLR208W 894 nt5.92□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 SAM37YMR060C 984 nt5.92□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 YOR314WYOR314W 330 nt5.92□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 CIN2YPL241C 807 nt5.92□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 URK1YNR012W 1506 nt5.92□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.92□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 VMA2YBR127C 1554 nt5.92□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 NOP2YNL061W 1857 nt5.92□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 TRE2YOR256C 2430 nt5.91□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 TYW3YGL050W 822 nt5.91□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 GVP36YIL041W 981 nt5.91□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 APQ13YJL075C 417 nt5.91□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 CCP1YKR066C 1086 nt5.91□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 PIN2YOR104W 849 nt5.91□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 GAL7YBR018C 1101 nt5.91□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 YOR200WYOR200W 399 nt5.91□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 YOR238WYOR238W 912 nt5.91□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt5.91□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.91□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 YBR124WYBR124W 360 nt5.91□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 HIR1YBL008W 2523 nt5.9□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 YCL065WYCL065W 369 nt5.9□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 MDH3YDL078C 1032 nt5.9□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 YRA1YDR381W 681 nt5.9□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt5.9□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt5.9□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 SVP26YHR181W 687 nt5.9□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 LNP1YHR192W 837 nt5.9□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 ARG1YOL058W 1263 nt5.9□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 SGT1YOR057W 1188 nt5.9□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 MRP51YPL118W 1035 nt5.9□□□□□ -1.46
CDC55Q00362 GUA1YMR217W 1578 nt5.89□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.89□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 YDL057WYDL057W 987 nt5.89□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 SHU2YDR078C 672 nt5.89□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 RUB1YDR139C 234 nt5.89□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 MMF1YIL051C 438 nt5.89□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 JLP1YLL057C 1239 nt5.89□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 LST8YNL006W 912 nt5.89□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 MLC2YPR188C 492 nt5.89□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 TRS20YBR254C 528 nt5.89□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 VPS38YLR360W 1320 nt5.89□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 YFL042CYFL042C 2025 nt5.89□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 RGD1YBR260C 2001 nt5.89□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 ATP1YBL099W 1638 nt5.88□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 RPL13AYDL082W 600 nt5.88□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 DON1YDR273W 1098 nt5.88□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 YGR064WYGR064W 369 nt5.88□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 AUR1YKL004W 1206 nt5.88□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 YMR187CYMR187C 1296 nt5.88□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 RER2YBR002C 861 nt5.88□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 RSA1YPL193W 1146 nt5.88□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 SEC12YNR026C 1416 nt5.88□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 WTM2YOR229W 1404 nt5.88□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 SMF2YHR050W 1650 nt5.88□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 FLC3YGL139W 2409 nt5.87□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 YCL076WYCL076W 744 nt5.87□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 RPL35BYDL136W 363 nt5.87□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 BI2Q0110 1272 nt5.87□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 RPL24AYGL031C 468 nt5.87□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 YGL185CYGL185C 1140 nt5.87□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 SCM4YGR049W 564 nt5.87□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 PAN6YIL145C 930 nt5.87□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 DCN1YLR128W 810 nt5.87□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt5.87□□□□□ -1.47
CDC55Q00362 MPP6YNR024W 561 nt5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.4 ms