Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1A1P68104 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EEF1A1P68104 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms