Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CSNK2BP67870 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSNK2BP67870 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms