Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKP1P63208 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKP1P63208 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKP1P63208 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKP1P63208 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKP1P63208 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKP1P63208 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKP1P63208 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKP1P63208 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKP1P63208 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKP1P63208 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKP1P63208 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKP1P63208 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKP1P63208 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKP1P63208 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKP1P63208 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKP1P63208 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKP1P63208 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKP1P63208 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKP1P63208 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKP1P63208 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SKP1P63208 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKP1P63208 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKP1P63208 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SKP1P63208 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKP1P63208 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SKP1P63208 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SKP1P63208 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKP1P63208 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKP1P63208 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SKP1P63208 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SKP1P63208 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKP1P63208 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKP1P63208 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKP1P63208 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKP1P63208 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKP1P63208 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKP1P63208 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKP1P63208 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKP1P63208 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKP1P63208 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SKP1P63208 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKP1P63208 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKP1P63208 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKP1P63208 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKP1P63208 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKP1P63208 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKP1P63208 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKP1P63208 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKP1P63208 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKP1P63208 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKP1P63208 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SKP1P63208 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKP1P63208 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKP1P63208 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKP1P63208 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SKP1P63208 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKP1P63208 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKP1P63208 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKP1P63208 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKP1P63208 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKP1P63208 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKP1P63208 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKP1P63208 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SKP1P63208 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKP1P63208 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SKP1P63208 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKP1P63208 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKP1P63208 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SKP1P63208 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SKP1P63208 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKP1P63208 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKP1P63208 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKP1P63208 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKP1P63208 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKP1P63208 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKP1P63208 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKP1P63208 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SKP1P63208 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms