Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS28P62857 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS28P62857 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS28P62857 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS28P62857 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RPS28P62857 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS28P62857 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS28P62857 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS28P62857 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS28P62857 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS28P62857 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS28P62857 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS28P62857 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS28P62857 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS28P62857 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS28P62857 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS28P62857 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS28P62857 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RPS28P62857 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RPS28P62857 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RPS28P62857 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RPS28P62857 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RPS28P62857 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RPS28P62857 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RPS28P62857 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RPS28P62857 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS28P62857 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS28P62857 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS28P62857 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS28P62857 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS28P62857 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS28P62857 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS28P62857 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS28P62857 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS28P62857 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RPS28P62857 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS28P62857 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS28P62857 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS28P62857 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS28P62857 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPS28P62857 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms