Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RPS29P62273 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPS29P62273 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RPS29P62273 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPS29P62273 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPS29P62273 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RPS29P62273 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RPS29P62273 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RPS29P62273 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RPS29P62273 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RPS29P62273 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RPS29P62273 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RPS29P62273 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RPS29P62273 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RPS29P62273 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RPS29P62273 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RPS29P62273 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RPS29P62273 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RPS29P62273 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RPS29P62273 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RPS29P62273 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RPS29P62273 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RPS29P62273 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RPS29P62273 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RPS29P62273 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RPS29P62273 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RPS29P62273 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RPS29P62273 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RPS29P62273 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RPS29P62273 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RPS29P62273 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RPS29P62273 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RPS29P62273 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RPS29P62273 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RPS29P62273 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RPS29P62273 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RPS29P62273 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RPS29P62273 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RPS29P62273 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RPS29P62273 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RPS29P62273 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RPS29P62273 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RPS29P62273 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RPS29P62273 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RPS29P62273 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RPS29P62273 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RPS29P62273 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RPS29P62273 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RPS29P62273 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RPS29P62273 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RPS29P62273 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RPS29P62273 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RPS29P62273 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RPS29P62273 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RPS29P62273 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RPS29P62273 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RPS29P62273 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RPS29P62273 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RPS29P62273 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RPS29P62273 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RPS29P62273 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RPS29P62273 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RPS29P62273 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RPS29P62273 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RPS29P62273 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RPS29P62273 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RPS29P62273 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RPS29P62273 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RPS29P62273 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RPS29P62273 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RPS29P62273 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RPS29P62273 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RPS29P62273 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RPS29P62273 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RPS29P62273 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
RPS29P62273 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
RPS29P62273 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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