Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP1CAP62136 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP1CAP62136 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP1CAP62136 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP1CAP62136 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP1CAP62136 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP1CAP62136 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP1CAP62136 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP1CAP62136 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP1CAP62136 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP1CAP62136 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP1CAP62136 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP1CAP62136 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP1CAP62136 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP1CAP62136 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP1CAP62136 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP1CAP62136 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PPP1CAP62136 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPP1CAP62136 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPP1CAP62136 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PPP1CAP62136 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPP1CAP62136 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPP1CAP62136 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPP1CAP62136 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP1CAP62136 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP1CAP62136 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP1CAP62136 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP1CAP62136 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP1CAP62136 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP1CAP62136 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP1CAP62136 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP1CAP62136 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP1CAP62136 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPP1CAP62136 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP1CAP62136 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPP1CAP62136 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms