Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VBP1P61758 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VBP1P61758 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VBP1P61758 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VBP1P61758 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VBP1P61758 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VBP1P61758 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VBP1P61758 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VBP1P61758 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VBP1P61758 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VBP1P61758 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VBP1P61758 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VBP1P61758 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VBP1P61758 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VBP1P61758 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VBP1P61758 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VBP1P61758 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VBP1P61758 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VBP1P61758 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VBP1P61758 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VBP1P61758 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VBP1P61758 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VBP1P61758 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VBP1P61758 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VBP1P61758 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VBP1P61758 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VBP1P61758 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VBP1P61758 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VBP1P61758 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VBP1P61758 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VBP1P61758 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VBP1P61758 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VBP1P61758 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VBP1P61758 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VBP1P61758 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VBP1P61758 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VBP1P61758 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VBP1P61758 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VBP1P61758 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VBP1P61758 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VBP1P61758 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VBP1P61758 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VBP1P61758 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VBP1P61758 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VBP1P61758 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VBP1P61758 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VBP1P61758 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VBP1P61758 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VBP1P61758 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VBP1P61758 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VBP1P61758 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VBP1P61758 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VBP1P61758 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VBP1P61758 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VBP1P61758 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VBP1P61758 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VBP1P61758 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VBP1P61758 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VBP1P61758 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VBP1P61758 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VBP1P61758 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VBP1P61758 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
VBP1P61758 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
VBP1P61758 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
VBP1P61758 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VBP1P61758 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VBP1P61758 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VBP1P61758 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
VBP1P61758 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VBP1P61758 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VBP1P61758 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VBP1P61758 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VBP1P61758 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VBP1P61758 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VBP1P61758 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VBP1P61758 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VBP1P61758 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VBP1P61758 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VBP1P61758 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VBP1P61758 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VBP1P61758 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VBP1P61758 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VBP1P61758 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VBP1P61758 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VBP1P61758 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VBP1P61758 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VBP1P61758 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VBP1P61758 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
VBP1P61758 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VBP1P61758 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VBP1P61758 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VBP1P61758 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VBP1P61758 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VBP1P61758 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VBP1P61758 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VBP1P61758 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VBP1P61758 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VBP1P61758 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VBP1P61758 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VBP1P61758 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms