Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARF3P61204 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARF3P61204 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARF3P61204 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARF3P61204 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARF3P61204 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARF3P61204 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARF3P61204 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARF3P61204 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARF3P61204 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ARF3P61204 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARF3P61204 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARF3P61204 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARF3P61204 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARF3P61204 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARF3P61204 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ARF3P61204 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARF3P61204 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARF3P61204 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARF3P61204 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARF3P61204 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARF3P61204 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARF3P61204 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARF3P61204 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARF3P61204 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARF3P61204 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARF3P61204 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARF3P61204 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARF3P61204 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARF3P61204 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARF3P61204 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARF3P61204 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARF3P61204 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARF3P61204 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARF3P61204 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARF3P61204 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARF3P61204 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARF3P61204 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARF3P61204 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARF3P61204 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARF3P61204 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARF3P61204 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARF3P61204 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ARF3P61204 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARF3P61204 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARF3P61204 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARF3P61204 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARF3P61204 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARF3P61204 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARF3P61204 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARF3P61204 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARF3P61204 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARF3P61204 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARF3P61204 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARF3P61204 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARF3P61204 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARF3P61204 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARF3P61204 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARF3P61204 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARF3P61204 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARF3P61204 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARF3P61204 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARF3P61204 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARF3P61204 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARF3P61204 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARF3P61204 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARF3P61204 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARF3P61204 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARF3P61204 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARF3P61204 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARF3P61204 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARF3P61204 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARF3P61204 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARF3P61204 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARF3P61204 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARF3P61204 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARF3P61204 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARF3P61204 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARF3P61204 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARF3P61204 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARF3P61204 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARF3P61204 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARF3P61204 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARF3P61204 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARF3P61204 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARF3P61204 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARF3P61204 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARF3P61204 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARF3P61204 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARF3P61204 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARF3P61204 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARF3P61204 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARF3P61204 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARF3P61204 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARF3P61204 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARF3P61204 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARF3P61204 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARF3P61204 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARF3P61204 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARF3P61204 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms