Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
CTXN1P60606 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTXN1P60606 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms