Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN2P57739 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLDN2P57739 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms