Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF3P57682 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF3P57682 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF3P57682 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF3P57682 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF3P57682 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF3P57682 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF3P57682 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF3P57682 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF3P57682 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF3P57682 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF3P57682 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF3P57682 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLF3P57682 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF3P57682 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF3P57682 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF3P57682 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF3P57682 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF3P57682 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF3P57682 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF3P57682 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF3P57682 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF3P57682 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF3P57682 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF3P57682 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF3P57682 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF3P57682 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF3P57682 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF3P57682 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF3P57682 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLF3P57682 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF3P57682 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF3P57682 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF3P57682 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF3P57682 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF3P57682 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF3P57682 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF3P57682 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF3P57682 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF3P57682 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF3P57682 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF3P57682 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF3P57682 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF3P57682 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF3P57682 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF3P57682 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF3P57682 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF3P57682 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLF3P57682 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF3P57682 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF3P57682 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF3P57682 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF3P57682 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF3P57682 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF3P57682 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF3P57682 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF3P57682 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLF3P57682 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLF3P57682 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLF3P57682 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF3P57682 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF3P57682 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF3P57682 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF3P57682 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF3P57682 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF3P57682 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF3P57682 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF3P57682 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF3P57682 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF3P57682 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF3P57682 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF3P57682 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF3P57682 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF3P57682 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF3P57682 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF3P57682 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KLF3P57682 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KLF3P57682 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms