Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSCP56915 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSCP56915 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSCP56915 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSCP56915 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSCP56915 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GSCP56915 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSCP56915 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSCP56915 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSCP56915 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSCP56915 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSCP56915 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GSCP56915 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSCP56915 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSCP56915 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GSCP56915 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSCP56915 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GSCP56915 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSCP56915 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSCP56915 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSCP56915 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSCP56915 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSCP56915 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSCP56915 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSCP56915 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSCP56915 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSCP56915 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSCP56915 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSCP56915 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSCP56915 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSCP56915 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSCP56915 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GSCP56915 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSCP56915 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSCP56915 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSCP56915 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSCP56915 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSCP56915 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSCP56915 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSCP56915 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSCP56915 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSCP56915 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GSCP56915 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSCP56915 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSCP56915 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSCP56915 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSCP56915 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSCP56915 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSCP56915 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSCP56915 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GSCP56915 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSCP56915 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSCP56915 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSCP56915 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSCP56915 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSCP56915 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSCP56915 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSCP56915 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSCP56915 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GSCP56915 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSCP56915 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSCP56915 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSCP56915 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSCP56915 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSCP56915 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSCP56915 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSCP56915 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSCP56915 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSCP56915 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSCP56915 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GSCP56915 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GSCP56915 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GSCP56915 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GSCP56915 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GSCP56915 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSCP56915 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSCP56915 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSCP56915 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GSCP56915 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSCP56915 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSCP56915 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSCP56915 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GSCP56915 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSCP56915 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSCP56915 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSCP56915 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSCP56915 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSCP56915 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSCP56915 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSCP56915 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSCP56915 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSCP56915 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GSCP56915 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSCP56915 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSCP56915 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSCP56915 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSCP56915 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSCP56915 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSCP56915 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GSCP56915 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms