Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLDN8P56748 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CLDN8P56748 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms