Protein–RNA interactions for Protein: P55789

GFER, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFERP55789 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFERP55789 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFERP55789 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFERP55789 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFERP55789 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFERP55789 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFERP55789 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFERP55789 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFERP55789 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFERP55789 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFERP55789 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFERP55789 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFERP55789 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFERP55789 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFERP55789 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFERP55789 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFERP55789 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFERP55789 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFERP55789 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFERP55789 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFERP55789 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFERP55789 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFERP55789 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GFERP55789 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFERP55789 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFERP55789 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFERP55789 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFERP55789 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFERP55789 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFERP55789 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFERP55789 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFERP55789 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFERP55789 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFERP55789 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFERP55789 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFERP55789 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFERP55789 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFERP55789 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFERP55789 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFERP55789 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFERP55789 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFERP55789 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFERP55789 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFERP55789 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFERP55789 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFERP55789 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFERP55789 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFERP55789 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFERP55789 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFERP55789 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFERP55789 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFERP55789 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFERP55789 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFERP55789 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GFERP55789 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GFERP55789 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GFERP55789 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GFERP55789 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GFERP55789 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GFERP55789 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GFERP55789 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GFERP55789 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GFERP55789 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GFERP55789 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GFERP55789 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFERP55789 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GFERP55789 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFERP55789 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFERP55789 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GFERP55789 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFERP55789 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GFERP55789 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFERP55789 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GFERP55789 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GFERP55789 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GFERP55789 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GFERP55789 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GFERP55789 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GFERP55789 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GFERP55789 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFERP55789 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GFERP55789 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFERP55789 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFERP55789 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GFERP55789 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GFERP55789 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GFERP55789 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GFERP55789 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GFERP55789 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GFERP55789 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GFERP55789 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GFERP55789 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GFERP55789 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFERP55789 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GFERP55789 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GFERP55789 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFERP55789 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFERP55789 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFERP55789 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GFERP55789 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms