Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELLP55199 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELLP55199 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELLP55199 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELLP55199 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELLP55199 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELLP55199 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELLP55199 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELLP55199 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELLP55199 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELLP55199 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELLP55199 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ELLP55199 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELLP55199 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELLP55199 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELLP55199 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELLP55199 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELLP55199 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELLP55199 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELLP55199 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELLP55199 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELLP55199 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELLP55199 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELLP55199 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELLP55199 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ELLP55199 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELLP55199 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELLP55199 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELLP55199 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELLP55199 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELLP55199 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELLP55199 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELLP55199 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELLP55199 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ELLP55199 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELLP55199 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELLP55199 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELLP55199 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELLP55199 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELLP55199 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELLP55199 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELLP55199 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELLP55199 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELLP55199 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELLP55199 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ELLP55199 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELLP55199 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELLP55199 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELLP55199 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELLP55199 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELLP55199 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELLP55199 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELLP55199 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELLP55199 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELLP55199 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELLP55199 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELLP55199 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELLP55199 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELLP55199 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELLP55199 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELLP55199 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ELLP55199 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELLP55199 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELLP55199 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELLP55199 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELLP55199 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELLP55199 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELLP55199 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELLP55199 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELLP55199 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELLP55199 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELLP55199 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ELLP55199 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELLP55199 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELLP55199 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELLP55199 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELLP55199 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELLP55199 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELLP55199 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ELLP55199 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELLP55199 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELLP55199 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELLP55199 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELLP55199 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELLP55199 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELLP55199 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELLP55199 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ELLP55199 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELLP55199 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELLP55199 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELLP55199 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELLP55199 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELLP55199 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELLP55199 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ELLP55199 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELLP55199 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELLP55199 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELLP55199 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELLP55199 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ELLP55199 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms