Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CACNA2D1P54289 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CACNA2D1P54289 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CACNA2D1P54289 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms