Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THOP1P52888 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THOP1P52888 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THOP1P52888 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THOP1P52888 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THOP1P52888 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THOP1P52888 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THOP1P52888 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THOP1P52888 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THOP1P52888 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THOP1P52888 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THOP1P52888 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THOP1P52888 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THOP1P52888 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THOP1P52888 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THOP1P52888 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THOP1P52888 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THOP1P52888 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THOP1P52888 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
THOP1P52888 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THOP1P52888 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
THOP1P52888 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
THOP1P52888 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THOP1P52888 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THOP1P52888 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
THOP1P52888 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THOP1P52888 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THOP1P52888 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THOP1P52888 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THOP1P52888 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
THOP1P52888 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
THOP1P52888 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
THOP1P52888 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THOP1P52888 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THOP1P52888 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THOP1P52888 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
THOP1P52888 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THOP1P52888 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THOP1P52888 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THOP1P52888 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THOP1P52888 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THOP1P52888 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THOP1P52888 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THOP1P52888 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THOP1P52888 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOP1P52888 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOP1P52888 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOP1P52888 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOP1P52888 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOP1P52888 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOP1P52888 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOP1P52888 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOP1P52888 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOP1P52888 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOP1P52888 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOP1P52888 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THOP1P52888 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THOP1P52888 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THOP1P52888 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THOP1P52888 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THOP1P52888 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THOP1P52888 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
THOP1P52888 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THOP1P52888 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THOP1P52888 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THOP1P52888 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THOP1P52888 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THOP1P52888 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THOP1P52888 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THOP1P52888 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THOP1P52888 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THOP1P52888 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THOP1P52888 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THOP1P52888 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THOP1P52888 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
THOP1P52888 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THOP1P52888 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THOP1P52888 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
THOP1P52888 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THOP1P52888 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THOP1P52888 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THOP1P52888 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THOP1P52888 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THOP1P52888 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THOP1P52888 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
THOP1P52888 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
THOP1P52888 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THOP1P52888 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THOP1P52888 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THOP1P52888 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THOP1P52888 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THOP1P52888 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THOP1P52888 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THOP1P52888 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
THOP1P52888 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THOP1P52888 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
THOP1P52888 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THOP1P52888 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THOP1P52888 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
THOP1P52888 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms