Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK4P51957 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK4P51957 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NEK4P51957 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK4P51957 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK4P51957 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK4P51957 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK4P51957 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK4P51957 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK4P51957 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK4P51957 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK4P51957 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK4P51957 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK4P51957 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK4P51957 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEK4P51957 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEK4P51957 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEK4P51957 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEK4P51957 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEK4P51957 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEK4P51957 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEK4P51957 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEK4P51957 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEK4P51957 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NEK4P51957 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NEK4P51957 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEK4P51957 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEK4P51957 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEK4P51957 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEK4P51957 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEK4P51957 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEK4P51957 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEK4P51957 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEK4P51957 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEK4P51957 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NEK4P51957 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NEK4P51957 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NEK4P51957 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEK4P51957 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEK4P51957 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NEK4P51957 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEK4P51957 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEK4P51957 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEK4P51957 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEK4P51957 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK4P51957 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK4P51957 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK4P51957 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK4P51957 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK4P51957 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK4P51957 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK4P51957 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK4P51957 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK4P51957 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK4P51957 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK4P51957 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK4P51957 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEK4P51957 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEK4P51957 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEK4P51957 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEK4P51957 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEK4P51957 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEK4P51957 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEK4P51957 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEK4P51957 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEK4P51957 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEK4P51957 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEK4P51957 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEK4P51957 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEK4P51957 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEK4P51957 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEK4P51957 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEK4P51957 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEK4P51957 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEK4P51957 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEK4P51957 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEK4P51957 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEK4P51957 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEK4P51957 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK4P51957 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK4P51957 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK4P51957 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK4P51957 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK4P51957 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK4P51957 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK4P51957 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK4P51957 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK4P51957 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK4P51957 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK4P51957 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK4P51957 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEK4P51957 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEK4P51957 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NEK4P51957 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEK4P51957 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEK4P51957 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEK4P51957 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEK4P51957 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEK4P51957 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NEK4P51957 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms