Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DAP3P51398 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DAP3P51398 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DAP3P51398 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DAP3P51398 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DAP3P51398 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DAP3P51398 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DAP3P51398 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DAP3P51398 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DAP3P51398 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DAP3P51398 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DAP3P51398 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DAP3P51398 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DAP3P51398 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DAP3P51398 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
DAP3P51398 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DAP3P51398 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DAP3P51398 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DAP3P51398 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
DAP3P51398 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DAP3P51398 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DAP3P51398 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DAP3P51398 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DAP3P51398 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DAP3P51398 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
DAP3P51398 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
DAP3P51398 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
DAP3P51398 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DAP3P51398 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DAP3P51398 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DAP3P51398 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DAP3P51398 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DAP3P51398 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DAP3P51398 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DAP3P51398 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
DAP3P51398 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DAP3P51398 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DAP3P51398 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DAP3P51398 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DAP3P51398 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DAP3P51398 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DAP3P51398 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DAP3P51398 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DAP3P51398 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DAP3P51398 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DAP3P51398 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DAP3P51398 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DAP3P51398 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DAP3P51398 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DAP3P51398 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
DAP3P51398 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DAP3P51398 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DAP3P51398 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DAP3P51398 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DAP3P51398 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DAP3P51398 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DAP3P51398 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DAP3P51398 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DAP3P51398 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DAP3P51398 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DAP3P51398 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
DAP3P51398 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
DAP3P51398 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DAP3P51398 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DAP3P51398 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DAP3P51398 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DAP3P51398 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DAP3P51398 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DAP3P51398 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DAP3P51398 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DAP3P51398 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
DAP3P51398 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DAP3P51398 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DAP3P51398 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DAP3P51398 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DAP3P51398 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
DAP3P51398 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DAP3P51398 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DAP3P51398 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
DAP3P51398 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DAP3P51398 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DAP3P51398 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DAP3P51398 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DAP3P51398 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DAP3P51398 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DAP3P51398 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
DAP3P51398 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DAP3P51398 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DAP3P51398 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DAP3P51398 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DAP3P51398 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DAP3P51398 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DAP3P51398 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DAP3P51398 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DAP3P51398 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DAP3P51398 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DAP3P51398 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
DAP3P51398 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DAP3P51398 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
DAP3P51398 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms