Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE6CP51160 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PDE6CP51160 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE6CP51160 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE6CP51160 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE6CP51160 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE6CP51160 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE6CP51160 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE6CP51160 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE6CP51160 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE6CP51160 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE6CP51160 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PDE6CP51160 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE6CP51160 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE6CP51160 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE6CP51160 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE6CP51160 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE6CP51160 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE6CP51160 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE6CP51160 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE6CP51160 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PDE6CP51160 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms