Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB28P51157 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB28P51157 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB28P51157 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB28P51157 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB28P51157 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB28P51157 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB28P51157 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB28P51157 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB28P51157 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB28P51157 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB28P51157 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB28P51157 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB28P51157 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB28P51157 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB28P51157 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB28P51157 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB28P51157 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB28P51157 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB28P51157 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB28P51157 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB28P51157 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB28P51157 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB28P51157 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB28P51157 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB28P51157 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB28P51157 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB28P51157 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB28P51157 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB28P51157 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB28P51157 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB28P51157 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB28P51157 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB28P51157 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB28P51157 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB28P51157 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB28P51157 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB28P51157 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB28P51157 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB28P51157 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB28P51157 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB28P51157 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB28P51157 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB28P51157 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB28P51157 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB28P51157 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB28P51157 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB28P51157 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB28P51157 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB28P51157 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB28P51157 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB28P51157 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB28P51157 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB28P51157 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB28P51157 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB28P51157 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB28P51157 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB28P51157 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB28P51157 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB28P51157 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB28P51157 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB28P51157 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB28P51157 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB28P51157 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB28P51157 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB28P51157 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB28P51157 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB28P51157 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB28P51157 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB28P51157 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB28P51157 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB28P51157 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB28P51157 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB28P51157 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB28P51157 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB28P51157 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB28P51157 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB28P51157 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB28P51157 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB28P51157 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB28P51157 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB28P51157 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB28P51157 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB28P51157 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB28P51157 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB28P51157 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB28P51157 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB28P51157 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB28P51157 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB28P51157 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB28P51157 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB28P51157 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB28P51157 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB28P51157 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB28P51157 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB28P51157 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB28P51157 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB28P51157 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB28P51157 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB28P51157 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms