Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBP50607 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBP50607 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBP50607 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBP50607 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBP50607 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBP50607 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBP50607 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBP50607 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBP50607 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBP50607 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBP50607 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBP50607 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBP50607 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBP50607 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBP50607 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBP50607 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBP50607 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBP50607 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBP50607 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBP50607 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBP50607 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBP50607 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBP50607 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBP50607 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBP50607 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBP50607 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBP50607 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBP50607 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBP50607 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBP50607 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBP50607 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBP50607 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBP50607 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBP50607 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBP50607 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBP50607 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBP50607 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBP50607 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBP50607 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBP50607 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBP50607 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBP50607 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBP50607 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBP50607 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBP50607 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBP50607 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBP50607 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBP50607 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBP50607 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBP50607 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBP50607 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBP50607 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBP50607 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBP50607 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBP50607 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBP50607 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBP50607 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBP50607 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBP50607 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBP50607 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBP50607 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBP50607 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBP50607 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBP50607 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBP50607 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBP50607 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBP50607 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBP50607 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBP50607 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBP50607 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBP50607 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBP50607 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBP50607 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBP50607 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBP50607 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBP50607 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBP50607 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBP50607 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBP50607 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBP50607 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBP50607 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBP50607 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBP50607 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBP50607 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBP50607 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBP50607 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBP50607 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBP50607 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBP50607 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBP50607 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBP50607 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBP50607 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBP50607 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBP50607 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBP50607 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBP50607 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBP50607 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBP50607 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBP50607 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms