Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX5P50542 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PEX5P50542 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX5P50542 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX5P50542 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX5P50542 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX5P50542 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX5P50542 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX5P50542 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX5P50542 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX5P50542 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX5P50542 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX5P50542 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX5P50542 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX5P50542 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX5P50542 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PEX5P50542 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX5P50542 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX5P50542 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX5P50542 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX5P50542 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX5P50542 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX5P50542 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX5P50542 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX5P50542 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX5P50542 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX5P50542 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX5P50542 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX5P50542 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX5P50542 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PEX5P50542 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX5P50542 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX5P50542 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX5P50542 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX5P50542 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX5P50542 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX5P50542 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX5P50542 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX5P50542 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX5P50542 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX5P50542 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX5P50542 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX5P50542 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PEX5P50542 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PEX5P50542 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PEX5P50542 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX5P50542 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX5P50542 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX5P50542 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX5P50542 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX5P50542 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX5P50542 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PEX5P50542 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX5P50542 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX5P50542 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX5P50542 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX5P50542 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX5P50542 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX5P50542 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX5P50542 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX5P50542 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX5P50542 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX5P50542 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX5P50542 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX5P50542 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PEX5P50542 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX5P50542 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX5P50542 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX5P50542 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX5P50542 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX5P50542 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX5P50542 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PEX5P50542 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX5P50542 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX5P50542 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX5P50542 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX5P50542 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX5P50542 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX5P50542 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX5P50542 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX5P50542 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX5P50542 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX5P50542 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX5P50542 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX5P50542 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX5P50542 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PEX5P50542 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX5P50542 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX5P50542 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX5P50542 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX5P50542 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX5P50542 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX5P50542 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX5P50542 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX5P50542 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX5P50542 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX5P50542 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX5P50542 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX5P50542 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX5P50542 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms