Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK2P49760 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK2P49760 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK2P49760 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK2P49760 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK2P49760 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK2P49760 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK2P49760 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK2P49760 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK2P49760 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLK2P49760 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLK2P49760 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLK2P49760 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLK2P49760 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLK2P49760 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLK2P49760 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLK2P49760 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLK2P49760 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLK2P49760 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLK2P49760 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLK2P49760 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLK2P49760 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLK2P49760 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLK2P49760 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLK2P49760 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLK2P49760 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLK2P49760 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLK2P49760 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLK2P49760 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLK2P49760 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLK2P49760 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK2P49760 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK2P49760 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK2P49760 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK2P49760 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK2P49760 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK2P49760 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK2P49760 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK2P49760 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK2P49760 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK2P49760 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK2P49760 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK2P49760 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK2P49760 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK2P49760 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLK2P49760 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLK2P49760 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLK2P49760 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLK2P49760 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLK2P49760 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLK2P49760 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CLK2P49760 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLK2P49760 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLK2P49760 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLK2P49760 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLK2P49760 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CLK2P49760 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLK2P49760 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLK2P49760 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLK2P49760 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLK2P49760 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLK2P49760 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLK2P49760 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLK2P49760 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLK2P49760 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLK2P49760 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CLK2P49760 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLK2P49760 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLK2P49760 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLK2P49760 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLK2P49760 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLK2P49760 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLK2P49760 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLK2P49760 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLK2P49760 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLK2P49760 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLK2P49760 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLK2P49760 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLK2P49760 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLK2P49760 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLK2P49760 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLK2P49760 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLK2P49760 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLK2P49760 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLK2P49760 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLK2P49760 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLK2P49760 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLK2P49760 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLK2P49760 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLK2P49760 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLK2P49760 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLK2P49760 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLK2P49760 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLK2P49760 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLK2P49760 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLK2P49760 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLK2P49760 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLK2P49760 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLK2P49760 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLK2P49760 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms