Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
ALDH1A3P47895 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms