Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL28P46779 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL28P46779 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL28P46779 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL28P46779 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL28P46779 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL28P46779 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL28P46779 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL28P46779 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL28P46779 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL28P46779 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL28P46779 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL28P46779 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPL28P46779 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL28P46779 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL28P46779 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL28P46779 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL28P46779 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL28P46779 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL28P46779 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPL28P46779 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL28P46779 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL28P46779 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL28P46779 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RPL28P46779 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL28P46779 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL28P46779 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL28P46779 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL28P46779 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL28P46779 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL28P46779 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL28P46779 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL28P46779 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL28P46779 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL28P46779 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL28P46779 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL28P46779 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL28P46779 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL28P46779 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL28P46779 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RPL28P46779 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPL28P46779 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPL28P46779 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPL28P46779 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPL28P46779 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RPL28P46779 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPL28P46779 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RPL28P46779 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPL28P46779 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPL28P46779 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPL28P46779 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPL28P46779 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RPL28P46779 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RPL28P46779 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPL28P46779 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPL28P46779 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPL28P46779 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPL28P46779 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPL28P46779 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RPL28P46779 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RPL28P46779 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RPL28P46779 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPL28P46779 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RPL28P46779 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPL28P46779 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPL28P46779 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPL28P46779 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPL28P46779 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPL28P46779 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPL28P46779 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPL28P46779 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RPL28P46779 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPL28P46779 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPL28P46779 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPL28P46779 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPL28P46779 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPL28P46779 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPL28P46779 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPL28P46779 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPL28P46779 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPL28P46779 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPL28P46779 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPL28P46779 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPL28P46779 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPL28P46779 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPL28P46779 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPL28P46779 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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