Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCAMP43121 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCAMP43121 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCAMP43121 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCAMP43121 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCAMP43121 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCAMP43121 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCAMP43121 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCAMP43121 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCAMP43121 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCAMP43121 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCAMP43121 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MCAMP43121 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCAMP43121 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCAMP43121 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCAMP43121 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCAMP43121 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCAMP43121 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCAMP43121 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCAMP43121 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
MCAMP43121 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MCAMP43121 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCAMP43121 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MCAMP43121 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MCAMP43121 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCAMP43121 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCAMP43121 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCAMP43121 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCAMP43121 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCAMP43121 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCAMP43121 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCAMP43121 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCAMP43121 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCAMP43121 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCAMP43121 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCAMP43121 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MCAMP43121 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCAMP43121 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCAMP43121 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCAMP43121 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCAMP43121 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCAMP43121 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCAMP43121 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCAMP43121 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCAMP43121 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCAMP43121 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCAMP43121 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCAMP43121 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCAMP43121 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCAMP43121 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MCAMP43121 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCAMP43121 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCAMP43121 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCAMP43121 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCAMP43121 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCAMP43121 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCAMP43121 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCAMP43121 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCAMP43121 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCAMP43121 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCAMP43121 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCAMP43121 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCAMP43121 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MCAMP43121 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MCAMP43121 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCAMP43121 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCAMP43121 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MCAMP43121 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MCAMP43121 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MCAMP43121 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCAMP43121 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCAMP43121 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCAMP43121 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCAMP43121 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCAMP43121 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCAMP43121 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCAMP43121 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCAMP43121 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCAMP43121 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCAMP43121 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MCAMP43121 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCAMP43121 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCAMP43121 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCAMP43121 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCAMP43121 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCAMP43121 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCAMP43121 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCAMP43121 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCAMP43121 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCAMP43121 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCAMP43121 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCAMP43121 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCAMP43121 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCAMP43121 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCAMP43121 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCAMP43121 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCAMP43121 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCAMP43121 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCAMP43121 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCAMP43121 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms