Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIA1P42261 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIA1P42261 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms