Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
KDM5CP41229 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.82■■■■□ 3
KDM5CP41229 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.82■■■■□ 3
KDM5CP41229 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5CP41229 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
KDM5CP41229 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5CP41229 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5CP41229 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.81■■■■□ 3
KDM5CP41229 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5CP41229 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5CP41229 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5CP41229 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.81■■■■□ 3
KDM5CP41229 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5CP41229 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
KDM5CP41229 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5CP41229 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5CP41229 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.8■■■■□ 3
KDM5CP41229 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5CP41229 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.8■■■■□ 3
KDM5CP41229 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
KDM5CP41229 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5CP41229 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KDM5CP41229 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5CP41229 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5CP41229 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5CP41229 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5CP41229 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5CP41229 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.78■■■■□ 3
KDM5CP41229 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5CP41229 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM5CP41229 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
KDM5CP41229 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
KDM5CP41229 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KDM5CP41229 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
KDM5CP41229 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM5CP41229 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms