Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFC5P40937 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFC5P40937 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RFC5P40937 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFC5P40937 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RFC5P40937 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFC5P40937 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFC5P40937 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFC5P40937 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RFC5P40937 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFC5P40937 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFC5P40937 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFC5P40937 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFC5P40937 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFC5P40937 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFC5P40937 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFC5P40937 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFC5P40937 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFC5P40937 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFC5P40937 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFC5P40937 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFC5P40937 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RFC5P40937 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFC5P40937 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFC5P40937 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFC5P40937 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFC5P40937 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFC5P40937 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RFC5P40937 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFC5P40937 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFC5P40937 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFC5P40937 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFC5P40937 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFC5P40937 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFC5P40937 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFC5P40937 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFC5P40937 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFC5P40937 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFC5P40937 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFC5P40937 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFC5P40937 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFC5P40937 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFC5P40937 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFC5P40937 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFC5P40937 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFC5P40937 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFC5P40937 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFC5P40937 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFC5P40937 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFC5P40937 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFC5P40937 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFC5P40937 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFC5P40937 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFC5P40937 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFC5P40937 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFC5P40937 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC5P40937 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC5P40937 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC5P40937 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC5P40937 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC5P40937 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC5P40937 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC5P40937 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC5P40937 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC5P40937 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC5P40937 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC5P40937 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC5P40937 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC5P40937 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC5P40937 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFC5P40937 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC5P40937 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC5P40937 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC5P40937 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC5P40937 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC5P40937 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC5P40937 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFC5P40937 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC5P40937 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC5P40937 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC5P40937 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC5P40937 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC5P40937 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC5P40937 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC5P40937 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC5P40937 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC5P40937 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC5P40937 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFC5P40937 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC5P40937 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC5P40937 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC5P40937 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC5P40937 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC5P40937 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC5P40937 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC5P40937 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC5P40937 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC5P40937 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC5P40937 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFC5P40937 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms