Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP8P40818 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP8P40818 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP8P40818 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP8P40818 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP8P40818 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP8P40818 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP8P40818 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP8P40818 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP8P40818 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP8P40818 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP8P40818 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP8P40818 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP8P40818 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP8P40818 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP8P40818 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP8P40818 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP8P40818 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP8P40818 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP8P40818 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP8P40818 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP8P40818 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP8P40818 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP8P40818 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP8P40818 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP8P40818 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP8P40818 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP8P40818 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP8P40818 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP8P40818 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP8P40818 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP8P40818 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP8P40818 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP8P40818 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP8P40818 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP8P40818 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP8P40818 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP8P40818 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP8P40818 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP8P40818 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP8P40818 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP8P40818 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP8P40818 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP8P40818 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP8P40818 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP8P40818 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP8P40818 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP8P40818 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP8P40818 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP8P40818 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP8P40818 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP8P40818 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP8P40818 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP8P40818 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP8P40818 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP8P40818 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP8P40818 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP8P40818 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP8P40818 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP8P40818 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP8P40818 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP8P40818 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP8P40818 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP8P40818 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP8P40818 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP8P40818 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP8P40818 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP8P40818 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP8P40818 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP8P40818 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP8P40818 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP8P40818 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP8P40818 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP8P40818 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP8P40818 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP8P40818 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP8P40818 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP8P40818 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP8P40818 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP8P40818 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP8P40818 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP8P40818 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP8P40818 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP8P40818 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP8P40818 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP8P40818 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP8P40818 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP8P40818 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP8P40818 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP8P40818 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP8P40818 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP8P40818 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP8P40818 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP8P40818 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP8P40818 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP8P40818 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP8P40818 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP8P40818 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP8P40818 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP8P40818 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms