Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTRLP40313 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTRLP40313 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTRLP40313 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTRLP40313 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTRLP40313 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTRLP40313 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTRLP40313 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTRLP40313 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTRLP40313 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTRLP40313 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTRLP40313 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTRLP40313 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTRLP40313 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRLP40313 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRLP40313 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRLP40313 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRLP40313 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRLP40313 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRLP40313 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRLP40313 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRLP40313 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRLP40313 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRLP40313 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRLP40313 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRLP40313 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRLP40313 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTRLP40313 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRLP40313 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRLP40313 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRLP40313 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRLP40313 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRLP40313 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRLP40313 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRLP40313 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRLP40313 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRLP40313 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRLP40313 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRLP40313 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRLP40313 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRLP40313 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRLP40313 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRLP40313 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRLP40313 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRLP40313 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTRLP40313 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRLP40313 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRLP40313 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRLP40313 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRLP40313 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRLP40313 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRLP40313 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRLP40313 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRLP40313 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRLP40313 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRLP40313 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRLP40313 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTRLP40313 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTRLP40313 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTRLP40313 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTRLP40313 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTRLP40313 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTRLP40313 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CTRLP40313 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRLP40313 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRLP40313 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRLP40313 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRLP40313 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRLP40313 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRLP40313 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRLP40313 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRLP40313 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRLP40313 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRLP40313 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRLP40313 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRLP40313 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRLP40313 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRLP40313 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTRLP40313 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRLP40313 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRLP40313 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRLP40313 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRLP40313 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRLP40313 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRLP40313 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRLP40313 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRLP40313 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRLP40313 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRLP40313 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRLP40313 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRLP40313 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRLP40313 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRLP40313 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRLP40313 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRLP40313 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRLP40313 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRLP40313 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTRLP40313 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTRLP40313 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTRLP40313 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms