Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXD13P35453 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXD13P35453 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms