Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDXP35241 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDXP35241 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDXP35241 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDXP35241 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDXP35241 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDXP35241 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDXP35241 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDXP35241 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDXP35241 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDXP35241 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDXP35241 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RDXP35241 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RDXP35241 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RDXP35241 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RDXP35241 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RDXP35241 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RDXP35241 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RDXP35241 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RDXP35241 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RDXP35241 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RDXP35241 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RDXP35241 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RDXP35241 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RDXP35241 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RDXP35241 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RDXP35241 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RDXP35241 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RDXP35241 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RDXP35241 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RDXP35241 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RDXP35241 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RDXP35241 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RDXP35241 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RDXP35241 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RDXP35241 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RDXP35241 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RDXP35241 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RDXP35241 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RDXP35241 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RDXP35241 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RDXP35241 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDXP35241 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDXP35241 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDXP35241 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDXP35241 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDXP35241 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDXP35241 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDXP35241 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDXP35241 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDXP35241 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDXP35241 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDXP35241 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RDXP35241 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RDXP35241 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RDXP35241 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RDXP35241 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RDXP35241 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RDXP35241 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RDXP35241 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RDXP35241 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RDXP35241 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RDXP35241 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RDXP35241 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RDXP35241 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RDXP35241 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RDXP35241 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RDXP35241 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RDXP35241 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RDXP35241 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RDXP35241 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RDXP35241 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RDXP35241 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RDXP35241 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RDXP35241 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RDXP35241 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RDXP35241 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RDXP35241 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RDXP35241 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RDXP35241 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RDXP35241 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RDXP35241 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RDXP35241 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RDXP35241 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RDXP35241 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RDXP35241 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RDXP35241 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RDXP35241 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RDXP35241 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RDXP35241 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RDXP35241 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RDXP35241 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RDXP35241 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RDXP35241 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RDXP35241 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RDXP35241 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RDXP35241 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RDXP35241 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RDXP35241 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RDXP35241 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms