Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMI1P35226 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMI1P35226 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
BMI1P35226 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMI1P35226 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMI1P35226 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMI1P35226 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMI1P35226 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMI1P35226 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMI1P35226 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMI1P35226 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMI1P35226 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMI1P35226 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMI1P35226 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMI1P35226 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMI1P35226 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMI1P35226 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
BMI1P35226 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMI1P35226 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMI1P35226 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMI1P35226 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMI1P35226 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMI1P35226 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMI1P35226 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMI1P35226 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMI1P35226 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMI1P35226 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMI1P35226 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMI1P35226 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMI1P35226 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMI1P35226 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BMI1P35226 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMI1P35226 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMI1P35226 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMI1P35226 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMI1P35226 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMI1P35226 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMI1P35226 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMI1P35226 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMI1P35226 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMI1P35226 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMI1P35226 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMI1P35226 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMI1P35226 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMI1P35226 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMI1P35226 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMI1P35226 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BMI1P35226 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMI1P35226 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMI1P35226 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BMI1P35226 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMI1P35226 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMI1P35226 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMI1P35226 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMI1P35226 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMI1P35226 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMI1P35226 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMI1P35226 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMI1P35226 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMI1P35226 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMI1P35226 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMI1P35226 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMI1P35226 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMI1P35226 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMI1P35226 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BMI1P35226 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BMI1P35226 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
BMI1P35226 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BMI1P35226 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BMI1P35226 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BMI1P35226 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BMI1P35226 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BMI1P35226 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BMI1P35226 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BMI1P35226 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BMI1P35226 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BMI1P35226 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BMI1P35226 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BMI1P35226 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BMI1P35226 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BMI1P35226 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BMI1P35226 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BMI1P35226 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BMI1P35226 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BMI1P35226 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BMI1P35226 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BMI1P35226 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BMI1P35226 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMI1P35226 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMI1P35226 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BMI1P35226 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMI1P35226 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BMI1P35226 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BMI1P35226 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMI1P35226 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
BMI1P35226 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMI1P35226 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMI1P35226 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMI1P35226 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BMI1P35226 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms