Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CTNNB1P35222 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTNNB1P35222 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTNNB1P35222 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms