Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTNNA1P35221 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNA1P35221 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 281.4 ms