Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC13P31276 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC13P31276 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms