Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXA13P31271 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXA13P31271 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms