Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBL1P28749 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBL1P28749 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBL1P28749 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBL1P28749 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBL1P28749 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBL1P28749 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBL1P28749 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBL1P28749 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBL1P28749 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBL1P28749 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBL1P28749 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBL1P28749 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBL1P28749 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBL1P28749 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBL1P28749 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBL1P28749 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBL1P28749 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBL1P28749 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBL1P28749 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBL1P28749 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBL1P28749 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBL1P28749 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBL1P28749 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBL1P28749 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBL1P28749 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBL1P28749 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBL1P28749 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RBL1P28749 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBL1P28749 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBL1P28749 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBL1P28749 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBL1P28749 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBL1P28749 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBL1P28749 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBL1P28749 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBL1P28749 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBL1P28749 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBL1P28749 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBL1P28749 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBL1P28749 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBL1P28749 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBL1P28749 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBL1P28749 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBL1P28749 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBL1P28749 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBL1P28749 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBL1P28749 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBL1P28749 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBL1P28749 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RBL1P28749 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RBL1P28749 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBL1P28749 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBL1P28749 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBL1P28749 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBL1P28749 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RBL1P28749 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RBL1P28749 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RBL1P28749 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RBL1P28749 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RBL1P28749 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBL1P28749 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBL1P28749 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBL1P28749 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBL1P28749 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBL1P28749 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBL1P28749 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBL1P28749 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBL1P28749 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBL1P28749 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBL1P28749 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBL1P28749 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBL1P28749 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBL1P28749 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBL1P28749 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBL1P28749 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBL1P28749 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBL1P28749 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBL1P28749 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms