Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABRB3P28472 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GABRB3P28472 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GABRB3P28472 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms